Se si parte dal sud Italia è invece preferibile fare il viaggio in nave, imbarcando anche l'auto. Il percorso in nave può partire da Bari, fino a giungere a Dubrovnik, oppure da Ancona (centro Italia) e arrivare a Spalato. Una volta arrivati a destinazione (Dubrovnik), bisogna proseguire in auto verso Ljubinje, quindi verso Stolac; dopo essere entrati in Bosnia, occorre giungere a Mostar che dista circa 27 km da Medjugorie. Se si sceglie la partenza da Ancona, una volta terminato il viaggio in nave con destinazione Spalato, occorre proseguire in auto verso Makarska e poi superare il confine con la Bosnia passando per Vrgorac. Infine si giunge a Ljubuski, per poi arrivare al luogo di culto di Medjugorie.